In meiner Erinnerung ist die Strecke von Brunnen nach Flüelen durchgehend Radweg, höchstens sehr kurze Stücke nicht. Umgekehrt, von Flüelen nach Brunnen sieht das anders aus. Kann mich aber täuschen, das ist schon länger her.
Wenn mit anderen Verkehrsmitteln umgehen, dann würde ich eher das Schiff empfehlen, ist natürlcih auch imposant. Oder die Bahn, die ist zwischen Brunnen und Flüelen auch bezahlbar und schneller als das Schiff. Ein Auto jedoch habe zumindest ich auf Radreisen selten dabei