Hallo Andreas,
ich bin gerade vor zwei Tagen aus dem französischen Jura zurück. Dabei bin ich in wesentlichen Teilen dem track von Jürgen gefolgt.
Ich war ohne Zelt unterwegs und muss sagen dass das _spontane_ Finden von Unterkünften deutlich schwieriger war als erwartet. Für den selben oder den darauffolgenden Tag waren (vor allem am Wochenende) die vorhandenen chambres d'hôtes und Hotels/Pensionen oft schon ausgebucht. Vielleicht lag es auch an dem fantastischen Wetter… Ich bin einmal (von Morteau aus) mit einer Bahnfahrt davongekommen und habe ansonsten dann weiter im Voraus gesucht und gebucht, das hat dann gut geklappt. Es hängt natürlich auch davon ab wie eng Dein Budget ist. Ausserdem helfen die offices de tourisme leider meist nur für die nähere Umgebung weiter und also eben nicht für den Ort an dem Du am nächsten oder übernächsten Tag sein wirst.
Was mir geholfen hat ist dass ich mir vorab Broschüren der Tourismusbüros der jeweiligen Regionen (Doubs, Jura, Ain) auf mein smartphone heruntergeladen hatte. So hatte ich Adressen von Unterkünften dabei die ich anrufen konnte. Einige der regionalen Tourismusbüros schicken auf Anfrage auch gedruckte Broschüren zu, z.B. hier: http://www.doubs.travel/publications.html oder hier: http://www.franche-comte.org/Footer/Section-1/Brochures
Ich kann auf Wunsch gerne noch Unterkünfte empfehlen. Sehr schön (aber schon weiter im Süden im Tal des Ain) fand ich es z.B. hier: http://www.chambresdhotes.org/english/Detailed/13405.html Super nett und sehr leckeres Abendessen, überwiegend aus der Produktion des eigenen Gartens und Hofes.
Ich hatte zwar Papierkarten dabei (von IGN), habe aber fast ausschließlich digitale OSM Karten benutzt. Falls Du Interesse an dem „La GTJ à vélo“ Büchlein hast (http://www.gtj.asso.fr/fr/no/menu-droite/boutique/liste-des-articles.html), das werde ich wohl demnächst im Marktplatz günstig anbieten.
Insgesamt war die Tour wirklich großartig, und dass Du ohne Kocher in Restaurants wirst essen müssen (und dazu das ein oder andere Glas Wein aus dem Jura trinken) wirst Du keinesfalls bereuen. schmunzel

Noch ein paar links von Tourismusbüros der Region:
http://www.ain-tourisme.com/pratiquez/velo/landing
http://www.jura-tourism.com/