Ich wuerde auch die Sattelhoehe ueberpruefen, eventuell hat sich durch die neuen Pedale die effektive Beinlaenge geaendert? Wenn die Beine nun weiter durchgestreckt werden, kann es auch dadurch zu Knieproblemen kommen. Auch zu ueberpruefen waere, ob die Beine wirklich gerade (d.h. entspannt) ausgerichtet sind, oder seitlich in eine unguenstige Drehung gezwungen werden - das kannst du mit flexiblen Cleats vermeiden, oder eben indem du die Cleats am Schuh entsprechend einstellst.

Ansonsten halte ich den runden Tritt, der durch die Cleats ermoeglicht wird, eher fuer vorteilhaft. Natuerlich solltest du prinzipiell darauf achten, nicht mit zu viel Kraft zu treten.